Der Kölner Betriebsteil ist der Sitz der GRS und auch der Geschäftsführung. In Köln sind alle GRS-Bereiche außer der Endlagersicherheitsforschung vertreten. Fachliche Schwerpunkte bilden die Reaktorsicherheitsanalysen sowie der Strahlen- und Umweltschutz. Darüber hinaus werden die Bereiche Projekte, Zentrale Dienste sowie der Projektträger Reaktorsicherheitsforschung von Köln aus gesteuert.